Puisque la très grande majorité des minéraux sont des composés chimiques cristallisés, il est normal d’essayer de comprendre les relations entre la composition chimique et la structure cristalline adoptée par une espèce minérale. Dans les minéraux, les liaisons sont principalement ioniques et covalentes et plus accessoirement métalliques. Il est donc important de savoir comment les atomes s’organisent dans une structure cristalline, et de connaître les outils mathématiques qui permettent de décrire et d’appréhender cette organisation. La cristallochimie est la science qui explique non seulement les propriétés chimiques et physiques des minéraux mais peut encore permettre une approche des conditions de formation.